Según los Estatutos del Colegio y el Reglamento de Régimen Interno, los órganos de gobierno y participación del Colegio Mayor Cardenal Cisneros son los siguientes:
Es el máximo órgano colegiado de gobierno ordinario del Colegio Mayor
Francisco José García Lozano
Rosana Suely de Carvalho Landim Batista
Rosana Suely de Carvalho Landim Batista
Alberto Borja Spinola
Rosalía López Fernández
Fernando Colodro Campos
Manuel Mata Torres
Es el segundo órgano de gobierno del Colegio Mayor
Francisco José García Lozano
Rosana Suely de Carvalho Landim Batista
Francisco José García Lozano
Eduardo Lupión Lorente
Elena Bueno Cano
Carmen Peñarrubia de Paco
Octavio Ventura Vela
Jorge Molina López-Cózar
Es el máximo órgano colegiado de gobierno ordinario del Colegio Mayor
Francisco José García Lozano
Rosana Suely de Carvalho Landim Batista
Rosana Suely de Carvalho Landim Batista
Alberto Borja Spinola
Rosalía López Fernández
Fernando Colodro Campos
Manuel Mata Torres
Es el segundo órgano de gobierno del Colegio Mayor
Francisco José García Lozano
Rosana Suely de Carvalho Landim Batista
Francisco José García Lozano
Eduardo Lupión Lorente
Elena Bueno Cano
Carmen Peñarrubia de Paco
Octavio Ventura Vela
Jorge Molina López-Cózar